본 대학 부사관과는 2006년 9월 28일 육군본부와 학군제휴협정을 체결하였다. 육군본부 대회의실에서 체결된 이 협정으로 부사관학과 재학생들은 육군선발 심의를 거쳐 군장학생으로 선발돼 장학금을 받고 부사관으로 임관할 수 있게 되었다. 이번 학군제휴협정으로 부사관과 학생들은 병영체험과 무도 등 군 관련 과목 40학점을 이수하여야 한다. 이를 위해 대학 측에서는 군에서 필요한 내용을 사전에 교육하기 위하여 군 출신 예비역 영관급 장교를 초빙교수로 채용하여 군사이론과 전술을 겸비한 우수한 사관후보생을 양성한다. 학군제휴협정은 육군본부에서 부사관과가 개설대학을 직접 방문하여 학과 운영 실태를 실사한 후 체결된 협정으로 부사관과 중에서도 내실 있고 우수함을 내외적으로 평가를 받은 것이다.